Η Οικία Φαρδύ χτίστηκε με χρήματα του Ιατροφιλοσόφου Νικολάου Β. Φαρδύ (1853-1879), ο οποίος υπήρξε εξέχουσα προσωπικότητα της Σαμοθράκης. Σπούδασε στην Ευαγγελική Σχολή της Σμύρνης και στην συνέχεια ιατρός στη Μασσαλία και όταν επέστρεψε στο νησί του, εξάσκησε και εδώ την Ιατρική, ενώ διετέλεσε δήμαρχος, φιλόσοφός, ποιητής, συλλέκτης δημωδών μελωδιών, συγγραφέας βιβλίων και μεταφραστής άρθρων ιατρικού περιεχομένου (εκ της Γαλλικής), καθώς και συλλέκτης σπαραγμάτων από τον αρχαιολογικό χώρο της Παλαιόπολης, προς διάσωσή τους. Διακρίθηκε για την πνευματικότητα, το ήθος και την καλλιέργεια του. Η προσωπική του βιβλιοθήκη, η οποία αντικατοπτρίζει την ευρυμάθεια και το ανοιχτό πνεύμα του, δωρίθηκε στο Δήμο Σαμοθράκης. Χειρόγραφά του φυλάσσονται στη Γενάδειο Βιβλιοθήκη. Ήταν παντρεμένος με την Ασσανιώ Φραγκομιχάλη και πατέρας οκτώ παιδιών.
Την οικία κληρονόμησε η πρωτοκόρη του Φαρδύ Απαρθενιά Φαρδύ, η οποία παντρεύτηκε τον δάσκαλο Νικόλαο Ρηγόπουλο, με τον οποίο απέκτησε τέσσερα παιδιά. Το σπίτι κληρονόμησε ο πρωτότοκος γιός της Νικόλαος Ρηγόπουλος, ο οποίος διετέλεσε Βουλευτής Έβρου επί σειρά ετών.
Το κτίριο κρίθηκε διατηρητέο το έτος 2002, λόγω των ιδιαίτερων αρχιτεκτονικών του χαρακτηριστικών και μετατράπηκε σε τουριστικό κατάλυμα το 2015 από τους απογόνους του Φαρδύ.